Morihiko Dan adalah seorang detektif swasta yang terkenal. Karena usianya sudah lanjut, Detektif Morihiko berusaha mencari
bakat-bakat terpendam yang dimiliki oleh anak-anak muda Jepang untuk menjadi penerus dirinya. Untuk melaksanakan misinya inilah Morihiko membentuk sekolah khusus detektif yang diberi nama Dan Detektif School.
Sekolah detektif ini terbagi dakam beberapa kelas, sesuai kemampuan siswanya. Kelas terbaik sekaligus tersulit adalah Q class, kemudian berturut-turut diikuti oleh A Class, B Class, dan C Class. Namanya saja sekolah detektif, tentu saja materi yang diberikan pun berbeda dengan sekolah-sekolah umum. Di sekolah ini, siswanya dibekali dengan berbagai pelajaran untuk mengungkap suatu kejahatan seperti : identifikasi TKP, membaca psikologi, kemampuan menganalisa, hingga keterampilan bela diri.
Tokoh utama komik ini adalah Kyu, seorang anak muda yang sebenarnya agak bodoh namun berkeinginan untuk menjadi dtektif yang hebat. Walaupun agak bodoh, namun kemampuan analisa Kyu tidak bisa diremehkan. Ia ditemani oleh Ryu, anak muda yang tampan dan pandai; Meg, pemilik ingatan fotografis; serta Kazuma, ahli komputer dan memecahkan sandi. Dalam petualangannya, para murid DDS ini harus berhadapan dengan organisasi kejahatan Meisosei yang tidak hanya ahli dalam menyusun suatu tindakan kriminal, namun juga memiliki kemampuan hipnotis dan manipulasi psikologi yang sangat hebat.